Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP17L21D6R901 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP17L21D6R901 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP17L21D6R901 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L21D6R901 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L21D6R901 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L21D6R901 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L21D6R901 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L21D6R901 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L21D6R901 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L21D6R901 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L21D6R901 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L21D6R901 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L21D6R901 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L21D6R901 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L21D6R901 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L21D6R901 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP17L21D6R901 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L21D6R901 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L21D6R901 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L21D6R901 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L21D6R901 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L21D6R901 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms