Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IQCJ-SCHIP1C9J366 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms