Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIPT2A6NK58 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms