Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms