Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms