Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms