Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THSD7AQ9UPZ6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms