Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1BQ9UPS6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms