Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PNMA3Q9UL41 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms