Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms