Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN4Q9UJW0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms