Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms