Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPN3Q9UHW5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms