Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
KDM5BQ9UGL1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms