Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX1-2Q9UD57 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms