Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DBF4Q9UBU7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DBF4Q9UBU7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DBF4Q9UBU7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DBF4Q9UBU7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DBF4Q9UBU7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DBF4Q9UBU7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DBF4Q9UBU7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DBF4Q9UBU7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DBF4Q9UBU7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DBF4Q9UBU7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DBF4Q9UBU7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DBF4Q9UBU7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DBF4Q9UBU7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DBF4Q9UBU7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DBF4Q9UBU7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DBF4Q9UBU7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DBF4Q9UBU7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DBF4Q9UBU7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DBF4Q9UBU7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DBF4Q9UBU7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DBF4Q9UBU7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DBF4Q9UBU7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DBF4Q9UBU7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms