Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms