Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHPF2Q9P2E5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHPF2Q9P2E5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms