Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP36Q9P275 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms