Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMG20BQ9P0W2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms