Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TVP23BQ9NYZ1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms