Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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