Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms