Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDAP2Q9NXN4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDAP2Q9NXN4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms