Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms