Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRHQ9HD43 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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