Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms