Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A2Q9HAB3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms