Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNDIG1Q9H7V2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms