Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF3Q9H4D5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms