Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GFRA4Q9GZZ7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GFRA4Q9GZZ7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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