Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms