Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMES1Q9C002 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms