Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms