Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms