Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NPAS2Q99743 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms