Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3R4Q99570 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms