Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms