Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORCS2Q96PQ0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms