Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSNARE1Q96NA8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms