Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms