Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms