Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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