Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms