Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLMNQ96JQ2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLMNQ96JQ2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms