Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHIPL1Q96JK4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms