Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms