Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms