Protein–RNA interactions for Protein: Q96A58

RERG, Ras-related and estrogen-regulated growth inhibitor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERGQ96A58 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RERGQ96A58 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms