Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP4Q969X6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms